Некоторые методы, которые используют ботаники для исследования внутренней структуры растений:

• Метод наблюдения. 25 Применяется на макро- и микроскопическом уровнях. 5 Суть метода — установить индивидуальность объекта без искусственного вмешательства в его процессы жизнедеятельности. 25
• Метод сравнения. 25 Исследуемый объект сравнивают с похожими объектами. 5 Это помогает в классификации, так как в ходе сравнения определяются сходства и различия с близкими объекту формами. 5
• Метод эксперимента. 25 Объект или процесс изучают в специально созданных искусственных условиях. 25 Экспериментальный метод допускает специальное вмешательство исследователя в природу. 5
• Мониторинг. 25 Основан на непрерывном наблюдении за состоянием отдельных объектов, а также за тем, как протекают отдельные процессы. 5
• Моделирование. 25 Отдельные процессы и явления показывают и исследуют при помощи упрощённой имитации. 5 Преимущество моделирования в том, что таким образом изучают процессы, недоступные для изучения в живой природе или в условиях эксперимента. 5
• Статистический метод. 25 Основан на статистической обработке количественного материала, собранного в результате других исследований (наблюдений, экспериментов, моделирования). 25 Это позволяет всесторонне проанализировать материал и установить определённые закономерности. 2

Основной метод изучения внутреннего строения растений — изготовление тонких срезов, которые затем рассматривают в микроскоп. 4 Также используют поляризационную, ультрафиолетовую, люминесцентную, фазово-контрастную и электронную микроскопии, гистохимические методы исследования, рентгеноструктурный анализ и другие. 4