Какие методы использовались для секвенирования генома вируса SARS-CoV-2?

Для секвенирования генома вируса SARS-CoV-2 использовались разные методы, которые относятся к разным поколениям: elar.urfu.ru

• Первое поколение. elar.urfu.ru Секвенирование отдельных локусов гена, кодирующего S-белок, по методу Сенгера на автоматизированных секвенаторах. elar.urfu.ru
• Второе поколение (высокопроизводительное секвенирование нового поколения, NGS). elar.urfu.ru Секвенирование на платформе Illumina и панелях компаний Ion AmpliSeq, Paragon Genomics. elar.urfu.ru
• Третье поколение. elar.urfu.ru Секвенирование на платформе Oxford Nanopore. elar.urfu.ru

Также для секвенирования генома SARS-CoV-2 применялся протокол ARTIC Network. www.pharmjournal.ru genomemedicine.biomedcentral.com

Кроме того, для работы с геномом вируса использовали тест-систему VariFind™ SARS-Cov-2 assay от компании Parseq Lab и адаптированное программное обеспечение VariFind™ Software. www.pharmjournal.ru