Некоторые методы биотехнологии, которые используются для конструирования белков:

• Направленный мутагенез. 13 Внесение специфических изменений в кодирующие последовательности ДНК, приводящих к определённым изменениям в аминокислотных последовательностях. 3 Например, с использованием ПЦР и перекрывающихся праймеров вводят точечные мутации, получают вставки и делеции. 1
• Химические модификации боковых цепей. 1 С их помощью изменяют конкретные аминокислотные остатки в белке. 1
• Направленная эволюция белковых молекул. 1 Отбор белков с нужными свойствами из библиотек мутантных молекул. 1 Например, с помощью фагового дисплея. 1
• Компьютерные методы. 2 С их помощью моделируют поведение белка, используя функцию оценки энергии и математические алгоритмы для её минимизации. 2 Например, в молекулярной динамике используют эмпирические силовые поля, с их помощью для каждого атома вычисляют действующую на него силу и рассчитывают зависимость его положения от времени. 2