Некоторые механизмы защиты, которые используются в процессе фотосинтеза для уменьшения негативного влияния фотолиза:

• Циклический поток электронов в фотосистеме II. 3 Это защитный механизм, который включается, когда электронтранспортная цепь тилакоидов не справляется с утилизацией световой энергии или при повреждении системы фотолиза воды. 3
• Реакция Мелера. 2 В ходе этого процесса активная форма кислорода (суперокидрадикал) быстро нейтрализуется до перекиси водорода супероксиддисмутазой. 2 Затем пероксидазой перекись водорода восстанавливается до кислорода и воды. 2
• Хлородыхание. 2 В тилакоидной мембране присутствует NADPH-дегидрогеназа — фермент, который окисляет NADPH и передаёт электроны на пластохиноны. 2 Пластохиноны дальше могут окисляться на пластидной альтернативной оксидазе, в результате работы которой кислород восстанавливается до воды. 2
• Использование каротиноидов. 12 Эти вспомогательные фотосинтетические пигменты «тушат» триплетный хлорофилл и синглетный кислород, предохраняя фотосинтетический аппарат от фотодеструкции. 1 Также каротиноиды выполняют фотопротекторную функцию, защищая от излишка энергии возбуждения при высокой интенсивности света. 1