У грамотрицательных бактерий существует несколько механизмов секреции, среди них:

• Система Sec. 13 Через неё переносятся преимущественно неуложенные белки. 1 Особые белки-переносчики связываются в цитоплазме с белками-мишенями, имеющими соответствующий сигнал секреции на N-конце. 13
• Система Tat. 12 В отличие от Sec, эта система использует протонный градиент для транспорта к клеточной поверхности молекул белков, обладающих нативной структурой, или даже их олигомеров. 2
• Система секреции I типа. 13 Предполагает одношаговый перенос белка из цитозоля во внеклеточную среду посредством канала, проходящего через обе мембраны и периплазму. 13
• Система секреции II типа. 3 В клеточной мембране представлена платформой из по меньшей мере 4 белков. 3 В цитоплазме находится АТФаза, снабжающая систему энергией. 3
• Система секреции III типа. 3 Обеспечивает секрецию разнообразных белков через обе мембраны и периплазму. 3
• Система секреции IV типа. 4 Включает систему конъюгативного переноса плазмид, иногда объединяется с V типом секреции. 4