У прокариот существуют следующие механизмы регуляции транскрипции генов:

• На уровне оперона. 1 Оперон — это функциональная единица генома, в состав которой входят цистроны (гены, единицы транскрипции), кодирующие совместно или последовательно работающие белки и объединённые под одним (или несколькими) промоторами. 2

• Правильная посадка РНК-полимеразы в области промотора. 1 Использование продукта гена-регулятора — репрессора для управления началом транскрипции. 1 Репрессоры могут быть ДНК-связывающие или РНК-связывающие белки. 1

• Индукция. 4 Некоторые ферменты, необходимые бактерии для усвоения определённых питательных веществ, активно синтезируются в клетке только тогда, когда эти вещества присутствуют в культурной среде, и синтез их прекращается, если они удаляются из среды. 4

• Аттенуация. 4 Тонкая подстройка количества продукта в зависимости от концентрации присутствующего вещества. 4 Аттенуация возможна благодаря сопряжению транскрипции и трансляции у прокариот, то есть тому факту, что трансляция может происходить одновременно с транскрипцией. 4