Некоторые механизмы, обеспечивающие точность синтеза РНК-полимеразой:

• Взаимодействие начального нуклеотида гена и РНК-полимеразы. 1 Это позволяет ферменту закрепиться на цепочке и обрабатывать следующие нуклеотиды. 1
• Суперскрученность молекул ДНК. 1 Участок ДНК перед РНК-полимеразой раскручен, в нём существуют положительные компенсационные супервитки. 1 Участки ДНК позади фермента снова закручиваются, и в них присутствуют отрицательные супервитки. 1
• Выравнивание фосфатных групп рибонуклеотидов. 1 Аспарагиновые остатки в РНК-полимеразе связываются с ионами Mg2+, которые осуществляют этот процесс. 1
• Стимуляция эндонуклеазной активности РНК-полимеразы. 2 Бактериальные факторы GreA и GreB стимулируют этот процесс, что позволяет РНК-полимеразе снова получать шанс транскрибировать определённый участок матрицы. 2
• Использование сигма-фактора. 1 Он снижает сродство РНК-полимеразы к неспецифичным областям ДНК и в то же время повышает чувствительность фермента к определённым промоторам. 1