Некоторые математические методы, которые применяются в сфере вычислительной биологии:

• Разработка систем дифференциальных уравнений. 2 Этот метод распространён для изучения больших систем. 2
• Молекулярная динамика. 2 С её помощью моделируют биомолекулы как систему движущихся ньютоновских частиц с взаимодействиями, определяемыми силовым полем. 2
• Методы квантовой механики. 2 Они описывают молекулы с использованием волновых функций или электронных плотностей. 2 Квантовые методы ценны при изучении ферментов и ферментативных реакций. 2
• Статистические методы. 45 К ним относятся ранжирование, построение графиков и диаграмм, подсчёт среднего арифметического и квадратного отклонения, процентной доли в выборке и коэффициентов корреляции. 45