При сложном методе окрашивания микроорганизмов применяются последовательное использование нескольких красителей. 2

Некоторые красители, которые используются:

• Для окраски по Граму. 24 Мазок окрашивают карболовым раствором генцианового фиолетового в течение 1–2 минут. 2 Грамположительные бактерии окрашиваются в сине-фиолетовый цвет, грамотрицательные — в красный. 2
• Для окраски по Цилю-Нильсену. 2 Мазок окрашивают карболовым фуксином Циля при нагревании 3–5 минут, обесцвечивают раствором серной кислоты в течение 1–2 минут, промывают водой, докрашивают 3–5 минут метиленовым синим. 2 Кислотоустойчивые микроорганизмы окрашиваются в рубиново-красный цвет, некислотоустойчивые — в сине-голубой. 2
• Для окраски по Бурри-Гинсу. 2 Применяется для окраски капсульных бактерий. 2 Капсула не воспринимает красители, её выявляют негативным контрастированием фона по Бурри, а тела микробных клеток окрашиваются фуксином. 2 В результате на тёмном фоне видны бесцветная капсула и красные тельца микробов. 2
• Для окраски по Романовскому-Гимзе. 12 Используется смесь азура, эозина, метиленового синего. 2 Цитоплазма окрашивается в голубой цвет, ядра — в красный. 2