Некоторые исследования, которые были проведены для установления происхождения породы чихуахуа:

• Археологические раскопки. 2 В древних погребальных захоронениях в Колиме (штат Мексики) обнаружили скульптуры и чучела, датируемые 300 годом до н. э., изображающие собаку, похожую на чихуахуа. 2 В Центральной Америке нашли игрушечные статуэтки, датируемые 100 годами н. э., изображающие небольшую собаку с головой в форме яблока. 2
• Исследование ДНК. 1 В 2013 году учёные Королевского технологического института в Стокгольме сравнили митохондриальную ДНК чихуахуа с образцами азиатских и европейских собак и не нашли связи между ними. 1 Вместе с этим они обнаружили самый распространённый и одновременно уникальный для современной чихуахуа гаплотип. 1 Такой же гаплотип нашли и в образцах мексиканских доколумбовых собак. 1 Это доказывает, что предки чихуахуа жили в Мексике ещё до прибытия туда европейцев, а также опровергает теорию родства современных чихуахуа с китайскими хохлатыми собаками. 1