Некоторые инструменты, которые используются в биологии для изучения и классификации организмов:

• Наблюдение. 14 Непосредственное восприятие биологических объектов в естественных или лабораторных условиях. 1
• Описание. 1 Фиксирование характеристик организмов и явлений. 1
• Измерение. 14 Количественная оценка характеристик биологических объектов (например, длины, массы, объёма). 1
• Эксперимент. 14 Активное вмешательство исследователя в природные процессы для проверки гипотез и установления причинно-следственных связей. 1
• Моделирование. 1 Создание упрощённых моделей биологических систем для изучения их поведения. 1
• Использование увеличительных приборов. 1 Применение микроскопов и луп для изучения структур, недоступных невооружённому глазу. 1

Также в систематике для классификации организмов используются данные генетики, молекулярной биологии и других наук для построения эволюционных деревьев — кладограмм. 1