Согласно перечню организаций, утверждённому распоряжением Правительства РФ от 27.06.2018 №1293-р, к ведомству Министерства науки и высшего образования Российской Федерации относятся, например, такие институты и академии наук: 14
- Институт научной информации по общественным наукам Российской академии наук; 14
- Институт истории естествознания и техники им. С. И. Вавилова Российской академии наук; 14
- Всероссийский институт научной и технической информации Российской академии наук; 14
- Институт нанотехнологий микроэлектроники Российской академии наук; 4
- Библиотека по естественным наукам Российской академии наук; 14
- Центр исследования проблем безопасности Российской академии наук; 14
- Отделение научно-исследовательских работ ГИПРОНИИ Российской академии наук; 14
- Межведомственный центр аналитических исследований в области физики, химии и биологии при Президиуме Российской академии наук; 14
- Институт проблем развития науки Российской академии наук; 14
- Библиотека Российской академии наук; 14
- Институт природно-технических систем; 14
- Научный и издательский центр «Наука» Российской академии наук; 14
- Математический институт им. В. А. Стеклова Российской академии наук; 14
- Институт вычислительной математики им. Г. И. Марчука Российской академии наук; 14
- Институт системного программирования им. В. П. Иванникова Российской академии наук; 14
- Институт автоматизации проектирования Российской академии наук; 14
- Физический институт им. П. Н. Лебедева Российской академии наук; 1
- Физико-технический институт им. А. Ф. Иоффе Российской академии наук; 1
- Главная (Пулковская) астрономическая обсерватория Российской академии наук; 1
- Институт прикладной астрономии Российской академии наук; 1
- Специальная астрофизическая обсерватория Российской академии наук; 1
- Объединённый институт высоких температур Российской академии наук; 1
- Институт теоретической и прикладной электродинамики Российской академии наук; 1
- Институт проблем безопасного развития атомной энергетики Российской академии наук; 1
- Институт энергетических исследований Российской академии наук; 1
- Институт машиноведения им. А. А. Благонравова Российской академии наук; 1
- Институт прикладной механики Российской академии наук; 1
- Институт проблем механики им. А. Ю. Ишлинского Российской академии наук. 1