В основе взаимодействия мономеров в нуклеиновых кислотах лежат следующие химические связи:

1. Фосфодиэфирные связи. 15 В каждой цепи нуклеотиды соединяются между собой путём образования таких связей между дезоксирибозой одного и остатком фосфорной кислоты последующего нуклеотида. 1
2. Водородные связи. 15 Две цепи в единую молекулу объединяются при помощи водородных связей, возникающих между азотистыми основаниями, входящими в состав нуклеотидов, образующих разные цепи. 1 Количество таких связей между разными азотистыми основаниями неодинаковое, и вследствие этого они могут соединяться только попарно: азотистое основание А одной цепи полинуклеотидов всегда связано с Т другой цепи, а Г — тремя водородными связями с азотистым основанием Ц противоположной полинуклеотидной цепочки. 1