Фитолиты древних растений могут содержаться в донных отложениях озёр. 1 Ветер часто уносит фитолиты с верхнего слоя почвы и осаждает их в воде, где они опускаются на дно. 1

Также фитолиты встречаются в отложениях торфа в послеледниковых болотах и озёрных системах. 3 В таких отложениях много пыльцы и мелких растительных остатков, а слои располагаются в строгом порядке друг за другом, накапливаясь с известной скоростью год за годом. 3