Некоторые функции пилей бактерий во взаимодействии с другими организмами:

• Обеспечение правильного позиционирования особых молекул, обеспечивающих адгезию клеток. 1 Это важный этап заселения эпителия и проникновения патогенных бактерий в клетки организма хозяина, образования биоплёнок. 1
• Участие в конъюгации. 14 Пили обеспечивают перенос части генетического материала от донорской клетки к реципиентной. 4
• Задействование в движении бактериальных клеток. 1
• Служение местами прикрепления многих бактериофагов. 1

Кроме того, прикрепление пилей к эукариотическим клеткам может запускать в них определённые сигнальные каскады. 1