Некоторые функции палиндромных участков в молекулах ДНК:

• Обеспечение процессов терминации транскрипции гена (окончание синтеза белка). 1
• Место связывания регуляторных белков, например, гена белка репрессора. 1
• Участие в формировании некоторых типов нуклеиновых кислот, например, транспортных РНК. 12 Эти участки образуют петли (в том числе центральную) тРНК. 1
• Формирование крестообразных структур в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот, в которых каждая из цепей образует «шпильки». 12

Также палиндромные последовательности — обычная черта вирусных, прокариотических и эукариотических регуляторных районов (промоторов, терминаторов и ориджинов репликации). 4