Микробиальные родопсины выполняют различные функции, среди них:

• Фотосинтез (бактериородопсин). 5 Микробиальные родопсины способны преобразовывать энергию света в электрохимический потенциал, который возникает на мембране клетки и нужен для синтеза молекул АТФ. 2
• Фототаксис (сенсорные родопсины). 5 Эти функции обеспечиваются свето-индуцированным переносом протонов, катионов или анионов (хлора). 5
• Ионный транспорт. 1 Микробиальные родопсины могут функционировать как ионные насосы и каналы. 12

К микробиальным родопсинам относятся, например, протеородопсин, сенсорные родопсины, канальные родопсины одноклеточных водорослей, галородопсин и бактериородопсин галофильных архебактерий. 5