Хроматофоры в организме животных выполняют несколько функций:

• Формирование окраски. 24 Хроматофоры обусловливают окраску кожных покровов, их производных (волос, перьев), внутренних выстилок тела и глаз у многих групп беспозвоночных и всех позвоночных животных. 4
• Маскировка. 15 Некоторые виды животных могут быстро изменять свой цвет с помощью хроматофоров. 1 Этот процесс часто используется для маскировки. 1 Например, морская звезда может менять цвет своей кожи, чтобы камуфлироваться на дне моря. 5
• Коммуникация. 15 В некоторых случаях хроматофоры используются для привлечения внимания или выражения эмоций. 5 Например, павлины используют свои яркие хвостовые перья для привлечения самок во время спаривания. 5
• Терморегуляция. 4 Хроматофоры участвуют в защите животного организма от излишнего УФ-излучения. 4

Функция хроматофоров находится под контролем гормонов и нервной системы, зависит от времени года, освещённости, эндогенных ритмов и других факторов. 4