Гистоновые белки в компактизации хроматина выполняют следующие функции:

• Участие в формировании основной структурной единицы хроматина — нуклеосомы. 1 Вокруг гистонового октамера происходит закручивание сегмента спирали ДНК, что обеспечивает жёсткую фиксацию ДНК и образование универсальной структуры нуклеосомы. 1
• Обеспечение нуклеомерного уровня компактизации ДНК. 4 Гистоновые белки удерживают спиральную конфигурацию фибриллы изнутри «трубки». 4
• Стягивание нитей ДНК на входе и выходе из нуклеосом. 1 Это делают линкерные гистоны H1 и Н5, связываясь с межнуклеосомными сегментами ДНК. 1

Кроме того, наличие или отсутствие гистонов, изменение их количественного и качественного состояния влияет на компактность и активность хроматина. 2