Пластины на спине стегозавра могли выполнять разные функции, их назначение остаётся спорным. 24 Некоторые предположения:

• Защита. 2 Первоначально считалось, что пластины защищали от нападения сверху более высоких хищников. 2 Однако они были слишком хрупкими и оставляли незащищёнными бока. 2
• Терморегуляция. 2 Есть версия, что пластины были пронизаны кровеносными сосудами и участвовали в терморегуляции. 2
• Устрашение. 2 Пластины могли визуально увеличивать размер стегозавра, что отпугивало хищников. 2
• Коммуникация. 5 Есть предположение, что пластины использовались для привлечения внимания других родственных особей, подачи сигнала тревоги, симпатии, готовности к спариванию и прочего. 5

Шипы на хвосте стегозавра использовались для самообороны. 24 Напавшие на них хищники, такие, как аллозавры, могли получить от обозлённых стегозавров тяжёлые и даже смертельные ранения. 24