Промежуточный мозг выполняет следующие функции:

• Регулирует сложные двигательные рефлексы. 2
• Координирует работу внутренних органов. 2
• Осуществляет гуморальную регуляцию (обмен веществ, потребление воды и пищи, поддержание температуры тела). 2
• Вместе с большими полушариями участвует в организации всех сложных форм поведения, регуляции вегетативных реакций. 2 То есть он интегрирует сенсорные, двигательные и вегетативные функции, обеспечивая деятельность организма как единого целого. 2

С структурами промежуточного мозга связано восприятие чувства боли, коррекция различных видов чувствительности. 1 Он служит важнейшим пунктом докорковой интеграции различных систем мозга. 1