Некоторые функции кэпа на 5'-конце иРНК:

• Инициация трансляции. 5 Благодаря кэпу начальный участок иРНК прикрепляется к рибосоме. 5
• Защита транскрипта от деградации. 13 Присутствие кэпа на 5'-конце защищает молекулы мРНК от быстрой деградации под действием экзонуклеаз. 1
• Регуляция экспорта мРНК из ядра. 2 Комплекс связывания кэпа распознаётся компонентами ядерных пор и экспортируется в цитоплазму. 2
• Способствование удалению интрона, проксимального к 5'-концу. 2 Кэп способствует взаимодействию со сплайсосомой и удалению интрона. 2