Хроматофор в клетке может выполнять следующие функции:
У водорослей — осуществляет фотосинтез. 12 Отличается от хлоропласта упрощённым строением, меньшим размером и иным составом хлорофилла. 1 В хроматофорах находятся пигменты, которые придают окраску растению. 1
У животных — синтезирует пигменты, обусловливающие окраску кожных покровов, их производных (волос, перьев), внутренних выстилок тела и глаз. 4 Пигментные клетки обеспечивают защитную, агрессивную и брачную окраску, участвуют в терморегуляции и защите животного организма от излишнего УФ-излучения. 4
Функция хроматофоров находится под контролем гормонов и нервной системы, зависит от времени года, освещённости, эндогенных ритмов и других факторов. 4