Головной мозг речного окуня выполняет следующие функции:

• Передний мозг отвечает за переработку информации, получаемой от органов обоняния, также принимает участие в регуляции поведения рыб. 2
• Промежуточный мозг обеспечивает регуляцию обмена веществ. 2
• Средний мозг перерабатывает информацию от органа зрения и боковой линии. 1
• Мозжечок координирует сложные движения рыб. 1
• Продолговатый мозг регулирует работу мышечной, пищеварительной, дыхательной, кровеносной и выделительной систем. 1

Кроме того, за отдельными отделами мозга закреплены определённые жизненно важные функции:

• Передний отдел мозга регулирует центр обоняния. 4
• Средний отдел мозга регулирует зрение. 4
• Продолговатый мозг регулирует слух и осязание. 4
• Мозжечок отвечает за координацию движений. 4