Некоторые философские проблемы, которые возникают при анализе принципа дополнительности:

• Неоднозначность принципа. 4 Например, Н. Бор был убеждён, что результаты квантово-механических измерений нужно описывать с помощью понятий и терминов классической физики. 4 Но после применения принципа дополнительности эти понятия не переставали быть противоречивыми. 4
• Ограниченность рассуждений Н. Бора. 4 Учёный был ограничен размышлениями о природе системных признаков. 4 Например, он не учитывал, что при взаимодействии различных частей системы образуются новые признаки, которыми по отдельности эти части не обладали. 4
• Сложности с представлением научного и религиозного описания действительности как дополнительных. 5
• Проблема определения критериев «дополнительности». 5 Если не уточнить эти критерии, то дополнительные описания могут стать ярлыком, под которым скрываются нерешённые проблемы. 5
• Критика абсолютизации принципа дополнительности. 1 Н. Бор считал, что абсолютизация принципа дополнительности с его некорректным расширенным применением — это метафизическая догма, от которой он предостерегал исследователей. 1