Некоторые факторы, влияющие на степень спирализации белковой цепи:

• Взаимное отталкивание между подряд расположенными одноименно заряженными остатками аминокислот. 1 Если они находятся в цепи близко друг к другу, образование водородной связи между ними невозможно из-за взаимного отталкивания зарядов. 2
• Пространственное несоответствие между аминокислотами с большими радикалами. 1 В результате возникает участок раскрученности молекулы, не имеющий правильной периодической пространственной организации. 2
• Высокое содержание пролина. 12 Эта аминокислота резко меняет направление полипептидной цепи, что приводит к низкой степени спирализации. 1

Также на степень спирализации влияет первичная структура белка: появление в первичной последовательности разноименно заряженных или гидрофобных аминокислот через 3–4 аминокислотных остатка будет стабилизировать α-спираль, и наоборот, наличие одноименно заряженных аминокислот через 3–4 аминокислотных остатка приведёт к их отталкиванию, что не позволит образоваться α-спирали. 3