Некоторые факторы, влияющие на пунктуацию в составных союзах:

• Расчленение союза. 14 Запятая ставится перед второй частью союза, а первая включается в состав главной части сложноподчинённого предложения как соотносительное слово. 1 На расчленение влияют, например, логическое ударение на первую часть союза, отрицательная частица «не», наличие усилительных, ограничительных частиц, вводных слов или наречий перед союзом. 14
• Цельное нахождение союза в придаточной части. 14 Если придаточная часть следует за главной, запятая ставится только перед союзом. 1 Если придаточная часть находится внутри главной, запятые ставятся перед союзом и после всего придаточного предложения. 1
• Расположение придаточной части. 1 Если придаточная часть с составным союзом стоит перед главной, запятая ставится на границе частей. 4

Также на пунктуацию в составных союзах влияют особенности конкретных союзов: некоторые из них никогда не расчленяются, а в других запятая между частями союза ставится или не ставится в зависимости от расположения придаточной части. 14