Некоторые факторы, влияющие на частоту кроссинговера в геноме:

• Факторы окружающей среды. 1 Различные виды излучения (УФ-, рентгеновское и γ-излучение) в большинстве случаев увеличивают частоту кроссинговера, так как вызывают одно- и двуцепочечные разрывы в ДНК. 1
• Вещества, нарушающие структуру ДНК. 1 К ним относятся нитрозосоединения, а также агенты, алкилирующие и дезаминирующие азотистые основания. 1
• Температура. 1 На частоту рекомбинации также может оказывать влияние температура. 1
• Физиологическое состояние организма. 1 Например, чем старше самки дрозофил, тем реже у них происходит кроссинговер. 1 Голодание личинок повышает частоту кроссинговера, а недостаток воды, наоборот, понижает. 1
• Генетический контроль. 1 Например, кроссинговер отсутствует у самцов дрозофил, а также у самок тутового шёлкопряда. 1
• Структура хромосом. 2 Частота кроссинговера зависит от общей организации хромосомы: в окружении центромеры она значительно меньше, чем в средних частях плеч. 4
• Хромосомные перестройки и определённые мутации. 1 Они влияют на частоту кроссинговера, затрудняя его прохождение. 4