Некоторые этические и социальные проблемы, которые возникают в связи с развитием функциональной геномики:

• Вмешательство человека в естественные механизмы существования живых организмов. 1 Возникают вопросы о том, может ли человек стать творцом направленной биоэволюции, применима ли генетическая модификация к человеку и человеческому роду в целом. 1
• Генетическая дискриминация. 2 Необходимо разработать регулирующие нормы и создать механизм определения уровня потребности в генетическом тестировании, чтобы обеспечить ресурсами без дискриминации по признакам пола, этнического, религиозного, социального, экономического статуса. 5
• Влияние геномных исследований на уязвимые группы населения. 2 Для решения этой проблемы требуется разработка безопасных и надёжных политик и инфраструктуры обмена данными. 2
• Неперсонализированный фактор отношений. 5 Субъектом любого наблюдения (с целью диагностики, профилактики или лечения) становится не только индивидуум, а вся генетически связанная группа (семья, род, популяция). 5
• Технологический разрыв. 5 Существует несоответствие между числом возможностей для диагностирования наследственных заболеваний и возможностями их профилактики или лечения. 5
• Этическая дилемма. 5 Возникает в плане достижения справедливого распределения ресурсов между настоящим и будущим поколением. 5

Для решения этих проблем необходимы совместные усилия исследователей, клиницистов, политиков и общественности. 2