Преимущества использования определённых каталогов для проектов в Visual Studio:

• Организация. 1 Можно сгруппировать связанные проекты, что упрощает поиск нужного. 1
• Управление зависимостями. 1 Если один проект зависит от другого, его можно добавить в папку решения, содержащую другой проект. 1
• Контроль версий. 1 При внесении изменений в систему контроля версий все проекты в одной папке решения будут внесены вместе. 1

Недостатки:

• Виртуальные папки. 4 Они полностью виртуальные, поэтому физическую организацию проектов всё равно нужно проводить в файловой системе. 4

Также стоит учитывать, что слишком много проектов может сделать сложным управление зависимостями между ними. 1