Костные рыбы населяют различные экологические зоны океана, включая:

• Пелагическую зону. 1 В толще воды обитают, например, тунец, сельдь, белая акула. 1
• Прибрежно-придонную зону. 1 Она находится на глубине до 200 м, здесь живут камбала, бычки, скаты-хвостоколы. 1
• Глубоководную зону. 1 В ней обитают удильщики, химеры. 1

Также костные рыбы встречаются в литорали (приливно-отливной области). 2 Эта зона океана периодически бывает залита водой, а во время отлива частично или полностью освобождается от неё. 2 Условия среды здесь крайне неустойчивы, поэтому обитающие здесь животные, в том числе рыбы, должны быть адаптированы к постоянной смене условий. 2