Учёные выделяют четыре основные экологические группы гидробионтов: 1

1. Нейстон. 12 Организмы, обитающие в поверхностной плёнке воды и использующие силу поверхностного натяжения. 1 Например, клопы-водомерки, личинки некоторых моллюсков, ряд простейших и водорослей. 1
2. Нектон. 12 Активно плавающие в толще воды животные, способные противостоять течениям и преодолевать большие расстояния. 1 Обычно они имеют обтекаемую форму тела и хорошо развитые органы движения. 1 К ним относятся киты, ластоногие, рыбы, головоногие и другие. 1
3. Планктон. 12 Совокупность организмов, населяющих толщу воды в различных водоёмах и увлекаемых течениями. 1 В состав планктона входят фитопланктон, бактериопланктон и зоопланктон. 1
4. Бентос. 13 Организмы, обитающие на дне водоёмов и ведущие прикреплённый образ жизни (крупные водоросли, кораллы, губки и другие) либо перемещающиеся по дну (моллюски, черви). 1

Также выделяют перифитон — совокупность организмов, способных к обрастанию различных предметов и тел других организмов. 2