Некоторые достижения современной молекулярной биологии, поддерживающие теорию Дарвина:

• Разделение генов на регуляторные и структурные. 2 Регуляторные гены контролируют возникновение репродуктивных изолирующих механизмов, которые изменяются независимо от энзимных генов и вызывают быстрые изменения на морфологическом и физиологическом уровнях. 2
• Теория нейтральности. 2 Она создана на фундаменте молекулярной генетики и основана на том, что далеко не все мутации приводят к изменению последовательности аминокислот в соответствующей молекуле белка. 2 Следовательно, многие мутантные гены выполняют те же функции, что и нормальные гены, отчего отбор по отношению к ним ведёт себя полностью нейтрально. 2
• Эпигенетика. 1 Это совокупность молекулярных факторов, определяющих, как функционирует ДНК и какие гены проявляются, независимо от самой последовательности ДНК. 1 Например, к таким факторам относится метилирование ДНК, когда к ДНК присоединяются молекулярные компоненты, которые включают и выключают гены, а также регулируют уровень генной экспрессии. 1
• Сходство молекулярных структур и функций гомологичных белков и нуклеиновых кислот (ДНК, РНК) у членов разных таксономических единиц. 3 На базе этих методов возник новый раздел эволюционизма под названием «молекулярная эволюция», то есть изменения, происшедшие в гомологичных макромолекулах близко- и отдалённо родственных видов в процессе их исторического развития. 3