Некоторые доказательства, подтверждающие теорию о происхождении эукариот в результате симбиогенеза:

• Общее сходство по форме, размеру, ультраструктуре мембран митохондрий и бактерий, специфическими ферментными комплексами, хлоропластов и синезелёных водорослей. 1
• Кольцевая молекула ДНК. 1 Генетический материал митохондрий и пластид не связан с гистонами и по доле GC (гуанин-цитозин) ближе к ДНК бактерий, чем к ядерной ДНК эукариот. 3
• Образование путём бинарного деления независимо от клетки. 1 Если эукариотные клетки лишить митохондрий или хлоропластов, то они не появляются вновь, эти органоиды передаются только от исходной материнской клетки путём деления предшествующих. 1
• Сходство на ультраструктурном и биохимическом уровне. 1 Например, присутствие тилакоидов и специфических хлорофиллов, которые напоминают таковые образования в цианобактериях. 1
• Наличие собственного белкового синтеза. 1 У митохондрий и пластид есть свой аппарат синтеза белка — рибосомы. 2
• Высокая чувствительность митохондрий и хлоропластов к действию антибиотиков (эритромицин, хлорамфеникол, стрептомицин). 3
• Двуслойная мембрана: внутренний слой сходен по составу с бактериальными клетками, а внешний — с мембранами пищеварительных вакуолей эукариот. 1