В современном биотехнологическом производстве используются различные биообъекты, среди них:

• Вирусы. 13 В качестве биообъектов (с ослабленной патогенностью) их применяют для приготовления вакцин. 3
• Микробные клетки прокариот и эукариот. 13 Эти биообъекты являются продуцентами первичных метаболитов, используемых в качестве лекарственных средств: аминокислот, азотистых оснований, коферментов, моно- и дисахаридов, ферментов. 13
• Грибы. 25 Наибольший интерес для биотехнологии представляют микроскопические грибы, к которым относятся дрожжи, плесневые и другие микроорганизмы. 2 Они применяются в хлебопечении, пивоварении и в молочной промышленности. 2
• Высшие растения. 1 Они являются традиционным и наиболее обширным источником получения лекарственных средств. 1
• Органы, клетки и биоматериал животных. 1 В качестве биообъектов выступают млекопитающие, птицы, рептилии, амфибии, членистоногие, рыбы, моллюски. 13
• Органы и биоматериал организма человека. 1 С позиций биотехнологии человек стал биообъектом лишь после реализации возможности клонирования его ДНК в клетках микроорганизмов. 1

Также в качестве биообъектов используют макромолекулы, например ферменты всех известных классов, но наиболее часто — гидролазы и трансферазы. 13