Некоторые биологические процессы, основанные на донорно-акцепторном механизме:

• Образование локализованных ковалентных связей в молекулах и молекулярных ионах комплексных (координационных) соединений. 12 Связь формируется за счёт неподелённой пары электронов лиганда и свободной орбитали атома-комплексообразователя. 1
• Образование промежуточных продуктов (интермедиатов) реакции, например, комплексов с переносом заряда. 12
• Кислотно-основные превращения, связанные с переносом иона водорода (акцептора). 12
• Образование супрамолекулярных наноструктур. 12

Также донорно-акцепторный механизм описывает взаимодействие аминов с протонами кислот, в результате которого образуется соль алкиламмония. 4