Внутреннее оплодотворение у голосеменных растений даёт следующие биологические преимущества:

• Независимость от воды. 1 Благодаря этому голосеменные растения могут размножаться половым путём даже в пустыне и в бездождное время года. 1
• Появление эффективной единицы расселения — семени. 1 В отличие от спор, семена имеют не только вполне сформированный зародыш будущего спорофита, но и запасные питательные вещества, необходимые на первых этапах его развития. 3
• Защита от неблагоприятных природных факторов. 3 Плотные оболочки предохраняют семя от неблагоприятных факторов, губительных для большинства спор. 3
• Возможность пережить неблагоприятное время года. 1 Длительный период покоя даёт возможность пережить неблагоприятное время года, а также способствует более далёкому расселению. 1