Некоторые биогеохимические процессы, которые происходят с участием бактерий в природе:

• Углеродный цикл. 1 Фотосинтезирующие бактерии и цианобактерии преобразуют углекислый газ в органические соединения, а сапрофитные бактерии разрушают эти соединения, возвращая углерод в атмосферу в виде CO₂. 1
• Азотный цикл. 1 Азотфиксирующие бактерии преобразуют атмосферный азот в аммоний, который затем используется растениями. 1 Нитрифицирующие бактерии превращают аммоний в нитриты и нитраты, а денитрифицирующие бактерии возвращают азот в атмосферу, завершая цикл. 1
• Разрушение минералов и горных пород. 2 Например, силикатные бактерии разрушают полевые шпаты и фосфориты, освобождая при этом калий в доступной для растений форме и фосфорную кислоту. 2 Некоторые железобактерии окисляют и разрушают соединения железа. 2
• Формирование геологических отложений. 4 Микробные биоплёнки могут служить начальными участками зарождения кристаллов, которые способствуют образованию вторичных карбонатных отложений в пещерах. 3