Некоторые белки, которые участвуют в организации нуклеоида у бактерий:

• Топоизомеразы. 1 Контролируют суперспирализацию ДНК, которая играет важную роль в её компактизации, и обеспечивают протекание таких процессов, как репликация и транскрипция, для которых требуется раскручивание молекулы ДНК. 1
• Белки семейства SMC. 1 Поддерживают структурную организацию хромосом, в том числе участвуют в организации нуклеоида. 1
• Белки HU и H-NS. 23 Их называют гистоноподобными, взаимодействие с ДНК зависит от её последовательности, наличия в молекуле шпилек и изгибов. 2
• Минорные гистоноподобные белки FIS и IHF. 23 Обеспечивают пространственную организацию бактериальной геномной ДНК, влияют на её репликацию, рекомбинацию и экспрессию генов. 23