Знаки препинания влияют на структуру сложноподчинённого предложения (СПП), определяя расположение и выделение придаточной части. 14

Общее правило:

• Если придаточное стоит в начале предложения, то запятая ставится после него. 4
• Если придаточное стоит в конце предложения, то запятая ставится перед ним. 4
• Если придаточное стоит в середине предложения, то оно выделяется запятыми с двух сторон. 4

Некоторые другие правила:

• Если перед составными союзами есть слова лишь, только, ещё и, прежде всего, именно, очевидно, вероятно или частицы не и ни, то перед союзом нужно ставить запятую. 1 Например: «Он заболел лишь потому, что ходил без шарфа зимой». 1
• Если изъяснительные и условные (с союзом ли) придаточные стоят перед главным предложением и выделены интонацией, их разделяют тире. 1 Например: «Хочется ли перемен — кто знает». 1
• Иногда перед подчинительным союзом ставят двоеточие. 1 Например, если в части перед ним есть предупреждение о том, что дальше будет разъяснение: «Отец понял то, что ему нужно было понять: что они говорили о нём». 1