Жгутиковые эукариоты используют свои жгутики в экологических процессах следующим образом:

• Для движения. 2 Совершая сложные движения, отдалённо напоминающие восьмёрки, жгутики буквально «ввинчивают» жгутиконосцев в воду. 1
• Для создания тока, который приносит пищу. 2 У некоторых жгутиковых жгутики направляют пищу в цитостом или рот, где она проглатывается. 2
• В общем круговороте веществ. 1 В водоёмах многие жгутиковые являются пожирателями бактерий и других микроорганизмов. 1 Вместе с тем сами они служат пищей для более крупных животных организмов. 1 Например, выклевывающиеся из икринок мальки многих видов рыб на самых начальных этапах своей жизни питаются преимущественно простейшими. 1