Жемчужница положительно влияет на экосистему пресноводных водоёмов как природный биофильтр. 1 Она убирает воздействие болотных гуминовых кислот и других химических элементов, собирает питательные вещества. 2 Осаждаемые из воды в результате фильтрационной деятельности моллюсков взвешенные вещества входят в состав донных отложений рек, озёр и водохранилищ, служат пищей для других гидробионтов. 1

Кроме того, жемчужница служит индикатором качества воды. 2 По её присутствию можно оценить, что в водоёме нет критических обсыханий и воздействия химических факторов, которые могли бы привести к гибели моллюска. 2

Также жемчужница продлевает жизнь рыбе, которая иначе погибла бы вскоре после нереста, замедляя её старение, делая более живучей и позволяя, в конечном счёте, нереститься несколько раз в жизни. 4