Ядерный матрикс влияет на структурную поддержку и морфологию клеточного ядра следующим образом:

• Поддерживает форму и стабильность интерфазного ядра. 4 Он служит каркасной внутриядерной системой, которая объединяет все ядерные компоненты и поддерживает общую структуру ядра. 1
• Изменяет текучесть ядерной мембраны. 4 Это необходимо для выполнения основных функций матрикса, в особенности транспорта субъединиц рибосом через поровый комплекс. 4
• Модифицирует структуру хроматина. 4 Это имеет большое значение в репликации ДНК и транскрипции РНК (активации и инактивации генов). 4
• Вовлечён в синтез, процессинг и транспорт РНК в ядре. 25