Ядерные поры регулируют транспорт молекул между ядром и цитоплазмой следующим образом: они обеспечивают избирательный проход различных молекул через ядерную оболочку. 3

Пассивный транспорт через ядерные поры происходит путём простой диффузии молекул небольших размеров (ионов, метаболитов, мононуклеотидов и т. д.). 5 Проводимость ядерных пор для молекул разных размеров различна: белок массой менее 15 кДа проникает в ядро быстрее, чем белок массой более 30 кДа. 5

Активный транспорт требует затрат энергии, а также специальных белков-рецепторов и транспортных факторов. 5 Путём активного транспорта через ядерные поры могут проходить гораздо более крупные молекулы и целые надмолекулярные комплексы. 5 Например, рибосомные субчастицы массой до нескольких мегадальтон транспортируются из ядра в цитоплазму через ядерные поры. 5

Более крупные белки (свыше 40 кДа) могут пройти через ядерную мембрану, только если они несут специфическую сигнальную последовательность. 2 Такая последовательность, ориентирующая белок на ядро, состоит из 4 основных аминокислот и в отличие от других сигнальных последовательностей не расщепляется при переносе белка в ядро. 2