В третичной структуре белка различные типы аминокислот взаимодействуют друг с другом и с водой с образованием слабых нековалентных связей. 4

Некоторые типы взаимодействий:

• Ионные (солевые) связи. 2 Возникают при контакте положительно заряженных групп боковых радикалов лизина, аргинина, гистидина и отрицательно заряженной СООН-группы аспарагиновой и глутаминовой кислот. 2
• Водородные связи. 2 Возникают между двумя электроотрицательными атомами, когда протон водорода, ковалентно связанный с одним из этих атомов, располагается между ними. 2 Электроотрицательными (то есть обладающими повышенной способностью притягивать электроны) являются атомы О, N, F и другие. 2
• Гидрофобные силы взаимодействия. 2 Возникают между неполярными углеводородными радикалами аминокислотных остатков. 2 Молекулы воды, стремясь образовывать между собой водородные связи, выталкивают гидрофобные группы и молекулы, находящиеся в воде, заставляя их скучиваться, образовывать ассоциаты. 2
• Ковалентные дисульфидные связи. 24 Образуются между атомами серы остатков цистеина, стоящих в разных участках полипептидной цепи. 2

В результате формирования третичной структуры все части полипептидной цепи оказываются фиксированными относительно друг друга и создаётся стабильная конформация белка. 3