Иерархия таксонов влияет на изучение эволюционных связей между видами следующим образом:

• Позволяет учитывать степень родства. 1 Чем далее организмы отстоят друг от друга по родственным связям, тем большую таксономическую группу они образуют. 1
• Помогает понимать историческое развитие органического мира. 3 Правильно построенная таксономическая иерархия может служить моделью иерархической эволюции. 3
• Даёт возможность находить неизвестные родственные связи между разными видами или подтверждать выдвинутые ранее теории о существовании таких связей. 4 Для этого используются новые научные методы, например, морфологические, эмбриологические и палеонтологические. 1

Кроме того, иерархия таксонов проливает свет на неравномерность хода эволюционных преобразований организмов: периоды длительного существования видов без заметных морфологических изменений оказываются более продолжительными, чем сменяющие их кратковременные периоды видообразования. 5