Глубина водоёма влияет на состав и плотность населения водных организмов следующим образом:

• Для растений глубина влияет на световой режим. 2 Растения, живущие на поверхности воды, не испытывают недостатка света, а погружённые и особенно глубоководные относят к «теневой флоре». 2 Им приходится адаптироваться к недостатку света и изменению его состава выработкой дополнительных пигментов. 2
• Глубина влияет на животных, их окраску, видовой состав и другие характеристики. 2 Например, в светлых, поверхностных слоях воды обитают ярко и разнообразно окрашенные животные, глубоководные же виды обычно лишены пигментов. 2
• При большей глубине водоёма в нём больше объём воды, а значит, и валовое количество содержащихся в воде кислорода, биогенных веществ и пищевых организмов. 4