Вирусы влияют на глобальный круговорот биогенных элементов в водных экосистемах следующим образом:

1. Удаление из экосистемы части бактерий, уничтоженной вирусами, уменьшает интенсивность перевода нерастворимого (взвешенного в водной толще и осаждающегося на дно) биогенного вещества (различных частиц, отмерших организмов и др.) в растворённое (расщеплённое, гидролизованное). 1 Таким образом вирусы нарушают классическую пищевую цепь. 1
2. Разрушение бактерий вирусами приводит к высвобождению из них органических веществ. 1 За увеличением концентрации органических веществ в среде следует изменение сообщества других микроскопических организмов — микроводорослей. 1 Одни из них ответят на это активным ростом, «цветением», другие будут угнетены. 1
3. В результате вирусного лизиса хозяйских клеток в окружающую водную среду выделяются легкоусвояемые органические соединения. 4 При этом углерод и другие биогенные элементы из состава взвешенного органического вещества клеток переходят в растворимую форму. 4 Эти растворимые соединения активно используются гетеротрофными бактериями и остаются внутри планктонного микробного сообщества, не попадая на более высокие уровни трофических сетей (так называемый вирусный шунт). 4