Вирусы используют особенности вторичной структуры мРНК для трансляции, чтобы снизить конкуренцию за рибосомы и трансляционные факторы с многочисленными клеточными матрицами. 13

Некоторые способы:

• Использование IRES-элементов. 13 Это участки внутреннего связывания рибосом, которые делают трансляцию мРНК не зависящей от 5′-конца и, как следствие, от m7G-кэпа. 13
• Наличие CITE-элементов. 13 Они могут быть расположены, в том числе, в 3′-нетранслируемой области. 13
• Использование внутренних рамок. 13 Для их трансляции могут применяться разнообразные механизмы: пропускающее сканирование, соскальзывание 43S-комплекса, шунтирование или сопряжённая терминация-реинициация. 13

Некоторые из перечисленных особенностей делают вирусные мРНК менее требовательными к набору факторов инициации трансляции, что обеспечивает устойчивость к условиям клеточного стресса и антивирусным механизмам клетки. 13

Кроме того, вирусы могут создавать конкурентные преимущества для трансляции своих мРНК, инактивируя отдельные трансляционные факторы, подменяя их своими или провоцируя развитие стрессового ответа. 13