Вакуоли защищают растения от паразитов, содержа в себе токсины или их предшественники, такие как алкалоиды и полифенолы. 15

Механизм защиты: при повреждении клеток содержимое вакуолей вступает в реакцию с веществами цитоплазмы, образуя токсичные для животных вещества, которые отпугивают травоядных животных и предотвращают поедание растений. 1

Кроме того, вакуоли участвуют в защите клетки от вторгающихся микроорганизмов с помощью лизосом, которые борются с бактериями, вирусами и другими патогенами. 4